一般來說，企業(yè)進(jìn)行年度匯算清繳，大多按照如下程序來進(jìn)行：

一、調(diào)賬。

具體調(diào)節(jié)項(xiàng)目有：

1、收入：核查企業(yè)收入是否全部入賬，特別是往來款項(xiàng)是否還存在該確認(rèn)為收入而沒有入賬；

2、成本：核查企業(yè)成本結(jié)轉(zhuǎn)與收入是否匹配，是否真實(shí)反映企業(yè)成本水平；

3、費(fèi)用：核查企業(yè)費(fèi)用支出是否符合相關(guān)稅法規(guī)定，計(jì)提費(fèi)用項(xiàng)目和稅前列支項(xiàng)目是否超過稅法規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)；

4、稅收：核查企業(yè)各項(xiàng)稅款是否提取并繳納；

5、補(bǔ)虧：用企業(yè)當(dāng)年實(shí)現(xiàn)的利潤對以前年度發(fā)生虧損的合法彌補(bǔ)（5年內(nèi)）；

6、調(diào)整：對以上項(xiàng)目按稅法規(guī)定分別進(jìn)行調(diào)增和調(diào)減后，依法計(jì)算本企業(yè)年度應(yīng)納稅所得額，從而計(jì)算并繳納本年度實(shí)際應(yīng)當(dāng)繳納的所得稅稅額。

二、申報(bào)。

攜帶企業(yè)開展匯算清繳所需提供材料前往稅務(wù)部門提交。一般來說，這些材料主要包括：

1、企業(yè)財(cái)務(wù)、會計(jì)年度決算報(bào)表及其說明材料。包括資產(chǎn)負(fù)債表、損益表、現(xiàn)金流量表等有關(guān)財(cái)務(wù)資料；

2、企業(yè)與納稅有關(guān)的合同、協(xié)議書及憑證；

3、企業(yè)外出經(jīng)營活動稅收管理證明和異地完稅憑證；

4、境內(nèi)或者境外公證機(jī)構(gòu)出具的有關(guān)證明文件；

5、主管稅務(wù)機(jī)關(guān)要求報(bào)送的其他有關(guān)證件、資料。

三、審核。

主管機(jī)關(guān)受理企業(yè)申請，并對企業(yè)報(bào)送的材料進(jìn)行審核。若發(fā)現(xiàn)由主管稅務(wù)機(jī)關(guān)管理內(nèi)容有變化的，要求納稅人提供變更依據(jù)；若發(fā)現(xiàn)納稅人申報(bào)有計(jì)算錯(cuò)誤或漏項(xiàng)，將及時(shí)通知納稅人進(jìn)行調(diào)整、補(bǔ)充；若審核無誤，則確定企業(yè)當(dāng)年度應(yīng)納所得稅額及應(yīng)當(dāng)補(bǔ)繳的企業(yè)所得稅款，或者對多繳的企業(yè)所得稅款加以退還或抵頂下年度企業(yè)所得稅。

四、清繳。

企業(yè)納稅人根據(jù)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)確定的全年應(yīng)納所得稅額及應(yīng)補(bǔ)、應(yīng)退稅額，年度終了后5個(gè)月內(nèi)清繳稅款。至此，企業(yè)年度匯算清繳相關(guān)操作完成完成。