控制測(cè)試與實(shí)質(zhì)性測(cè)試的區(qū)別體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面：（1）控制測(cè)試的內(nèi)容為內(nèi)部控制，是定性評(píng)價(jià)；實(shí)質(zhì)性程序的內(nèi)容為賬戶(hù)金額，是定量評(píng)價(jià)。（2）控制測(cè)試的目的為評(píng)價(jià)內(nèi)部控制有效性；實(shí)質(zhì)性程序的目的是評(píng)價(jià)賬戶(hù)金額正確性，為發(fā)表審計(jì)意見(jiàn)提供依據(jù)。控制測(cè)試與實(shí)質(zhì)性程序的聯(lián)系體現(xiàn)在：控制測(cè)試為實(shí)質(zhì)性程序打基礎(chǔ)，控制測(cè)試的結(jié)果為確定實(shí)質(zhì)性程序的性質(zhì)、時(shí)間和范圍提供依據(jù)；實(shí)質(zhì)性程序是在控制測(cè)試的基礎(chǔ)上進(jìn)行的，實(shí)質(zhì)性程序的程度取決于控制測(cè)試的結(jié)果。不能完全省略實(shí)質(zhì)性測(cè)試程序的主要原因?yàn)椋海?）內(nèi)部控制是被審計(jì)單位為達(dá)到其經(jīng)營(yíng)管理目標(biāo)而設(shè)立和實(shí)施的，最嚴(yán)格的內(nèi)部控制也有其本身的固有限制；一是控制成本的限制，即被審計(jì)單位往往因考慮成本而犧牲內(nèi)部控制可能帶來(lái)的效益；二是人為因素的限制，包括有關(guān)人員不理解或錯(cuò)誤理解內(nèi)部控制，相關(guān)人員串通舞弊而回避或破壞內(nèi)部控制等。這些固有限制可能導(dǎo)致會(huì)計(jì)報(bào)表的重要反映失實(shí)。（2）內(nèi)部控制是否真正有效，需要通過(guò)執(zhí)行控制測(cè)試程序予以驗(yàn)證，但控制測(cè)試只能證實(shí)內(nèi)部控制是否有效和得到了一貫遵守，而不能對(duì)會(huì)計(jì)報(bào)表反映的合法性、公允性進(jìn)行證實(shí)。